医院污水来源具有多样性，主要为放射科、口腔科、病例科、手术室、各类检验室、洗衣房、食堂等科室和部门排放的印染废液、放射性污水、含汞污水、洗衣污水及食堂污水等。医院内不同科室与部门产生的水量及其所含污染物成分各不相同。
水量较小、波动较大，排放不规律，且存在季节性、周期性等差异。夏季排水量较大，其他季节相对较少；工作日排水量大，休息日排水量较小，且昼夜、早晚排放量差距较大。总体而言，医院的污水量与医院规模、床位数、就诊人数、工作人员人数及季节等因素有关。
医院污水受到粪便、传染性细菌和病毒等病原性微生物污染，具有空间污染、急性传染和潜伏性传染等特点，可以诱发疾病；医院污水中含有酸、碱、悬浮固体、COD和动植物油等有毒有害物质；牙科、洗印和化验等过程产生污水含有重金属、消毒剂、有机溶剂等，部分具有致癌、致畸或致突变性；同位素和诊断产生放射性污水，危害人体健康。
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