1、反渗透膜水解容易导致反渗透装置性能恶化。因此，必须严格控制水的pH值，供水的pH值在3-11范围内。
2、次氯酸钠用量不足，使给水中游离氯无法测定时，反渗透装置的膜组件上会有黏泥产生，反渗透装置的压差增大。但对于聚酰胺膜来讲，必须严格控制进入膜组件的游离氯量，超过规定值将导致膜的氧化分解。
3、如果将FI值超标的水作为水源供给反渗透装置，膜组件表面会附着污垢，必须通过清洗去除污垢。
4、给水流量过大会提前降解膜组件，因此给水流量不能超过设计标准值。另外，应尽量避免浓水流量小于设计标准值。如果浓水流量太会使反渗透装置的压力容器内发生不均匀的流动及由于过分浓缩而在膜组件上析出污垢。
5、即使反渗透装置的高压泵即使有极短的时间中断运转，装置也可能发生故障。
6、反渗透的入口压力应保持适当的裕度，否则由于没有适当的压实，会降低除盐率。
7、当反渗透装置停止运行时，反渗透装置中的水应更换为低压供水。这是为了防止停运期间二氧化硅的析出。
8、注意保安过滤器的压差。压差急剧上升的原因主要是保安过滤器的浊度泄漏。相反，出现压差急剧下降的原因是精密过滤器元件的破损，以及保安过滤器元件紧固螺丝松动等。
9、当反渗透装置进出口压差超标时，说明膜面已被污染或供水流量超过设计值。如果通过流量调节无法解决压差问题，则应清洗膜面。
10、夏季供水温度高，产水流量大，有时不得不降低操作压力，导致水质下降。为了防止这种情况，可以减少膜组件的根数，同时保持较高的操作压力。
